MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 9886

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011989	GGTGAT	2	12	1895615	1895626	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_011989	GC	3	6	1899926	1899931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5003	NC_011989	GGCG	2	8	1899969	1899976	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5004	NC_011989	GGT	2	6	1900023	1900028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_011989	ACC	2	6	1900099	1900104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5006	NC_011989	CGG	2	6	1900108	1900113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_011989	GCC	2	6	1900118	1900123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5008	NC_011989	TTTG	2	8	1903113	1903120	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_011989	GGAA	2	8	1903130	1903137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_011989	GTT	2	6	1904006	1904011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_011989	CTT	2	6	1904045	1904050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_011989	GAT	2	6	1904114	1904119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_011989	ATC	2	6	1904132	1904137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_011989	TTGCAG	2	12	1904210	1904221	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5015	NC_011989	GCA	2	6	1904277	1904282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_011989	CAC	2	6	1904302	1904307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5017	NC_011989	GCG	2	6	1904312	1904317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_011989	GGC	2	6	1904352	1904357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_011989	AATG	2	8	1904378	1904385	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_011989	CGG	2	6	1904410	1904415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_011989	ATC	2	6	1904480	1904485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_011989	TCT	2	6	1904601	1904606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_011989	GCTG	2	8	1904614	1904621	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5024	NC_011989	GAT	2	6	1904711	1904716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_011989	GACT	2	8	1912118	1912125	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5026	NC_011989	ACC	2	6	1912138	1912143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5027	NC_011989	CAT	2	6	1912167	1912172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_011989	CGC	2	6	1912278	1912283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5029	NC_011989	GCC	2	6	1912341	1912346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5030	NC_011989	GGC	2	6	1912352	1912357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_011989	T	7	7	1912358	1912364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_011989	TGG	2	6	1914733	1914738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_011989	TGAT	2	8	1916688	1916695	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_011989	TCT	2	6	1916762	1916767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_011989	GAT	2	6	1916814	1916819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_011989	GTC	2	6	1916829	1916834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_011989	ATT	2	6	1916904	1916909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_011989	CGC	2	6	1916913	1916918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5039	NC_011989	TC	3	6	1916935	1916940	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5040	NC_011989	GTCTTG	2	12	1916970	1916981	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5041	NC_011989	CGA	2	6	1917104	1917109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_011989	ATC	2	6	1917147	1917152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_011989	AGC	2	6	1917161	1917166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_011989	GC	3	6	1917212	1917217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5045	NC_011989	CGA	2	6	1917224	1917229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_011989	ATC	2	6	1917302	1917307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_011989	CAG	2	6	1917654	1917659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_011989	CGG	2	6	1917664	1917669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_011989	TGGC	2	8	1917688	1917695	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5050	NC_011989	CAT	2	6	1917722	1917727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_011989	TTC	2	6	1917740	1917745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_011989	CTGC	2	8	1917786	1917793	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5053	NC_011989	TGG	2	6	1917807	1917812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_011989	T	6	6	1918707	1918712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_011989	CAGATG	2	12	1918741	1918752	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5056	NC_011989	AGC	2	6	1918761	1918766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_011989	A	6	6	1919710	1919715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_011989	TC	3	6	1919739	1919744	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5059	NC_011989	CAT	2	6	1920218	1920223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_011989	GGT	2	6	1920278	1920283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_011989	CG	3	6	1920349	1920354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5062	NC_011989	CGAC	2	8	1920391	1920398	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5063	NC_011989	CGAC	2	8	1920400	1920407	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5064	NC_011989	GAA	2	6	1921483	1921488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_011989	GTGG	2	8	1921495	1921502	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_011989	TGT	2	6	1921613	1921618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_011989	GC	3	6	1921673	1921678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5068	NC_011989	CTG	2	6	1921689	1921694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_011989	TGC	2	6	1921700	1921705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_011989	GC	3	6	1921713	1921718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5071	NC_011989	AATGG	2	10	1922442	1922451	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_011989	CCAT	2	8	1922477	1922484	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5073	NC_011989	GAC	2	6	1922528	1922533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_011989	GTAG	2	8	1922570	1922577	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_011989	TGG	2	6	1922616	1922621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_011989	GCC	2	6	1923089	1923094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5077	NC_011989	TGC	2	6	1923208	1923213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_011989	GGC	2	6	1923217	1923222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_011989	CAGC	2	8	1923282	1923289	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5080	NC_011989	CT	4	8	1924340	1924347	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5081	NC_011989	CCTG	2	8	1924379	1924386	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5082	NC_011989	TGAT	2	8	1924432	1924439	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_011989	A	6	6	1926410	1926415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_011989	GTT	2	6	1926433	1926438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_011989	TCG	2	6	1926467	1926472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_011989	CGC	3	9	1926578	1926586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5087	NC_011989	TGA	2	6	1926612	1926617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_011989	CTGC	2	8	1926725	1926732	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5089	NC_011989	ATA	2	6	1926776	1926781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_011989	GGT	2	6	1926808	1926813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_011989	CGC	2	6	1926827	1926832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5092	NC_011989	TTG	2	6	1926926	1926931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_011989	CGG	2	6	1926938	1926943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_011989	TGC	2	6	1926953	1926958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_011989	TCTG	2	8	1927019	1927026	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5096	NC_011989	CTTA	2	8	1927036	1927043	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5097	NC_011989	GTA	2	6	1927083	1927088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_011989	AGGGG	2	10	1927228	1927237	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_011989	ATA	2	6	1927838	1927843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_011989	TTC	2	6	1927846	1927851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_011989	AAC	2	6	1927854	1927859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_011989	T	6	6	1927890	1927895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_011989	GTC	2	6	1927919	1927924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_011989	TCA	2	6	1927981	1927986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_011989	TTGG	2	8	1928010	1928017	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_011989	ATT	2	6	1928037	1928042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_011989	CAA	2	6	1928155	1928160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_011989	T	6	6	1928360	1928365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_011989	GC	3	6	1928390	1928395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5110	NC_011989	AAG	2	6	1928464	1928469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_011989	AT	3	6	1928500	1928505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_011989	ATC	2	6	1928529	1928534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_011989	CGC	2	6	1928563	1928568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5114	NC_011989	CGCC	2	8	1928612	1928619	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5115	NC_011989	CGA	2	6	1929919	1929924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_011989	CAG	2	6	1929961	1929966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_011989	ACG	2	6	1929994	1929999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_011989	GAG	2	6	1930066	1930071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_011989	TTG	2	6	1930081	1930086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_011989	T	6	6	1930109	1930114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_011989	AAG	2	6	1930175	1930180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_011989	TCAT	2	8	1930332	1930339	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5123	NC_011989	GCC	3	9	1930402	1930410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5124	NC_011989	T	6	6	1930434	1930439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_011989	AAT	2	6	1930477	1930482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_011989	GCC	2	6	1930503	1930508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5127	NC_011989	ATGTC	2	10	1930550	1930559	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5128	NC_011989	GCT	2	6	1930609	1930614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5130	NC_011989	T	6	6	1930917	1930922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5391	NC_011989	CACG	2	8	2055032	2055039	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5392	NC_011989	ACA	2	6	2055133	2055138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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